Przede wszystkim:

Tytuł powinien wstępnie opisywać problem; np.: "Odpowiednik filtra 'sponge'. Chmury: uzyskanie drobniejszego szumu."
(...)jak mogę zwiększyć rozmiar chmur? największy rozmiar to 16, są wtedy dosyć duże, a chciałbym żeby bardziej przypominały taki drobny "szum".
Zwiększ ilość szczegółów. Poza tym szczegółowość chmur jest zależna od wielkości powierzchni, na której zastosowano filtr. Spróbuj zastosować filtr na całej warstwie a następnie powtórz go z takimi samymi ustawieniami na zaznaczeniu obejmującym np. 1/4 powierzchni warstwy a zobaczysz różnicę. Aby pokryć takim drobnym szumem całą warstwę wystarczy utworzyć sobie bezszwowy deseń.
Jeśli natomiast chcesz uzyskać efekt z pierwszego załącznika, to zastosuj filtr:
Renderowanie -> Chmury -> Fog.
(...)to może jest jakiś filtr o podobnym działaniu?
Przecież Ziomioslaw podał Ci odnośniki, w których masz opisane jak uzyskać taki efekt w GIMP. Warto też zerknąć na ten wątek:
http://www.gimpchat.com/viewtopic.php?f=9&t=3035.
Można jeszcze spróbować za pomocą filtra:
Szum -> Wyciosaj (liczba powtórzeń: ok. 10) na warstwie z chmurami i ew. dostosować kolory za pomocą Poziomów lub Krzywych czy nawet zmniejszając kontrast. Teoretycznie pomocny powinien być filtr:
Artystyczne -> GIMPresjonista ale szczerze mówiąc sama za nim nie przepadam.
Więcej filtrów i więcej możliwości jeśli chodzi o tworzenie tekstur będziesz miał po zainstalowaniu wtyczek, takich jak np.:
G'MIC,
Impressionist,
Felimage-noise czy Plasma2.
Ostatni w załączniku.