Myślę, że nie ma żadnego problemu z tym waszym "ripple".

Dokładnie taki sam efekt można uzyskać poprzez stworzenie chmur na osobnej warstwie (z turbulencjami, bądź nie), jakichś małych, dobrze jest je potem jeszcze przyciemnić i rozjaśnić poziomami, a następnie stosować
filtry>odwzorowania>przesuwanie, można jeszcze posłużyć się
filtry>odwzorowania>deformowanie (tu efekt jest jeszcze fajniejszy:) jeśli uwzględnimy obroty o kąt i inne:) pobawić się parametrami i wychodzi fajnie)
Nie wątpcie w potęgę GIMP-a!