Miałem ten sam problem ale już go rozwiązałem, robimy tak (dla wersji 2.4):

- Odpalamy Gimpa
- Wchodzimy w Preferencje (Plik -> Preferencje)
- W Preferencjach wybieramy Foldery
- Następnie klikamy na czcionki
- Pojawia się ścieżka folderu z którego gimp czerpie fonty (C:\Documents and Settings\nazwa_uzytkownika\.gimp-2.4\fonts)
- Zmieniamy ją na standardowy folder przetrzymywania fontów przez Windows czyli C:\WINDOWS\Fonts
- Gotowe!

U mnie działa...