W GIMP-ie można "zaznaczyć" wybrany kolor, ale to zaznacza wszystkie pikselki niezależnie czy ze sobą sąsiadują, czy nie.
Tak działa zaznaczenie wg koloru, ale różdżką można zaznaczyć tylko sąsiadujące piksele.
Ogólnie metoda z zaznaczaniem nie zawsze się sprawdza. Jeśli np. masz jakiś samotny kształt na przezroczystym tle i po zaznaczeniu wypełnisz go innym kolorem, to jego krawędzie staną się postrzępione, bo kolor nałoży się na półprzezroczyste piksele zmniejszając ich przezroczystość. Lepiej w takim wypadku zablokować przezroczystość w oknie warstw i wypełnić kolorem bez użycia zaznaczenia. Jeśli ten kształt jest na białym lub czarnym tle, to lepszą metodą będzie użycie opcji
Barwienie. Wszystko zależy od tego, jak wygląda ta warstwa, więc ciężko doradzić najlepszy sposób nie widząc jej zawartości. A metod zmiany koloru jest wiele