Możesz otworzyć w Gimpie jedno zdjęcie i zmienić tryb obrazu na
odcienie szarości (
Obraz -> Tryb). Następnie zaznaczasz pozostałe zdjęcia i przeciągasz na okno Gimpa. Zdjęcia zostaną dodane jako warstwy i automatycznie zmienią kolor. Jeśli ich wymiary są różne, to trzeba jeszcze kliknąć:
Obraz -> Dopasuj płótno do warstw. Później wystarczy zapisać warstwy jako oddzielne obrazy używając odpowiedniego skryptu. Był jeszcze temat o wsadowym przetwarzaniu zdjęć. Zaraz poszukam skryptu i tego tematu. Poza tym do masowego przetwarzania zdjęć można użyć darmowego XnView (sama go używam).
@Edit
Tutaj temat o wsadowym przetwarzaniu fotografii w Gimpie:
http://www.gimpuj.info/index.php/topic,1264A tu link do skryptu:
http://www.gimpuj.info/index.php/topic,34874.0.html