Aby przesunąć wszystkie warstwy jednocześnie musisz je połączyć. Kliknij po lewej stronie warstwy w oknie warstw, a pojawi się ikona łańcucha. Kliknięcie z SHIFT-em powinno spowodować pojawienie się tej ikonki przy wszystkich warstwach, co oznacza, że wszystkie będą połączone.
Aby dodać drugą animację, musisz ją otworzyć jako warstwy i odpowiednio połączyć klatki obu animacji, tzn. pierwszą warstwę pierwszej animacji scalasz z pierwszą warstwą drugiej animacji, drugą warstwę pierwszej z z drugą warstwą drugiej itd. Jeśli liczba warstw w obu animacjach jest różna, trzeba będzie powielić jedną z nich i dopasować ilość warstw. Była już gdzieś o tym mowa i był nawet skrypt, który robi to automatycznie, zaraz poszukam.
@Edit:
Znalazłam skrypt:
http://registry.gimp.org/node/24408